1、半胱氨酸鹽酸鹽可溶于水，制成針劑或片劑可迅速被人體所吸收。它是羧甲基半胱氨酸和乙酰基半胱氨酸生產的主要原料。
2、在臨床上能治療白血球減少癥，及由于施用抗癌藥物和放射性藥物所引起的白血球減少癥，以及重金屬中毒解毒劑。此外還用于治療中毒性肝炎、血小板減少、皮膚潰瘍，并能預防肝壞死癥，有治療氣管炎和化痰作用，對丙稀晴和芳香族中毒有解毒作用，有預防放射線損傷的作用
3、面包改良劑：促進發酵、防止氧化的作用。在食品的方面作為面包速成促進劑，能改變面包和食品的風味。
4、在化妝品方面可用于化妝品的燙發精、防曬霜、生發香水和頭發調理劑等等。
5、營養增補劑、抗氧化劑、護色劑：用于天然果汁，防止維生素C氧化及色變。
